1) В Самаре в одной из лабораторий Ростехнадзор (или Роспотребнадзор, точно не помню) например сказал, что для РФА прибора нужна лицензия + СЭЗ и не волнует.
2) Если нужны именно "легитимные протоколы", то нужна аккредитация на РФА в какой либо из систем аккредитация (Росаккредитация, СДА от НТЦ...