Здравствуйте. Входной контроль как раз и начинается же с проверки сопроводительной документации, в том числе сертификатов. И если позже, на стадии инструментального контроля, выяснится, что фактическое состояние оборудования разнится с сертификатом соответствия, то, естественно, это повод заводить претензионную работу. Долгую и беспощадную.